关于嬴政的生父，官方给出的准确答案是嬴异人，但因为赵姬和吕不韦的混乱关系，不少记载断言吕不韦其实才是嬴政的亲生父亲，但这个论断并未被官方证实。
吕不韦在赵国的时候认识了秦国的太子的庶子子楚，吕不韦是当时的大商人，他认为子楚奇货可居，于是便决定帮助子楚做到未来秦王的位子上面，自己以便于混个一官半职。吕不韦不仅送给子楚很多金银财宝，而且还把自己心爱的歌女送给了子楚。其实在战国时期封建礼教观念并不是非常的浓重，所以吕不韦献上的赵姬是否曾经和吕不韦在一起过，对于子楚来说都是无所谓的。晋文公曾经娶了晋怀公的老婆，而赵姬仅仅是吕不韦的歌姬，子楚娶她在当时是比较合情合理的。
赵姬嫁给子楚后不久就生下了嬴政，而且在子楚死后，赵姬曾经和吕不韦旧情复燃，所以很多人以为嬴政是吕不韦的儿子。其实这个猜测的真实性并不是非常高，很多史料表明秦始皇是一个力大无穷的人，这比较符合秦国的国君的特征，而且古代虽然没有DNA检测，但是最起码有怀胎九月的尝试，除非说赵姬在嫁给子楚的前半个月内刚好怀了孩子。
如果这样的话，恐怕连赵姬都不知道孩子是谁的了，因为古代根本无法准确地推算怀孕的时间，所以才会有怀胎十月的说法（实际上大部分都是怀胎九月）。而且史料也没有表明赵姬是嫁给子楚多久生下来的嬴政，如果是在九个月内的话，一种可能是早产还有一种是吕不韦的孩子。不过这样子楚应该会有察觉，而如果是九个月后产下的秦始皇，子楚当时在世，吕不韦还需要利用子楚，肯定不敢和赵姬私通，也就是说如果赵姬嫁给子楚九个月之后生下的秦始皇，那么秦始皇肯定是子楚的孩子。这样来看秦始皇是吕不韦的孩子的说法很难能够站住脚，秦始皇应该就是子楚的孩子。
吕不韦在子楚死后和赵姬私通可能是真实存在的，但是吕不韦是秦始皇的父亲一事则是在汉朝时期才开始出现的。这主要是因为吕后想要证明自己的正统地位，当时天下还是比较信奉秦始皇的，所以吕雉就想出了这一个传言，来证明自己吕家的正统统治地位。
